GIÁO TRÌNH - Tin - Sinh học (Nguyễn Văn Cách) | Cộng đồng Kỹ thuật cơ điện Việt Nam EBOOKBKMT

Nguồn dữliệu cơsởnày, thực tếlà các dữliệu kết quảnghiên cứu thu được của từng cá nhân hay của các cơsởnghiên cứu rải rác khắp nơi trên thếgiới. Với đặc thù là ngành khoa học thực nghiệm, đây chính là sản phẩm kết tinh của khối lượng rất lớn lao động trí tuệ, hao phí vật chất, tiền bạc và tiêu tốn thời gian, công sức. Việc bảo quản tại chỗkết quảnghiên cứu này là không hiệu quảvà không thểtránh khỏi mất mát hay thất lạc, do nhiều nguyên nhân khác nhau, thí dụ: do cơsởhạtầng vật chất kỹthuật lạc hậu, năng lực tài chính hạn chế, điều kiện địa lý, khí hậu không thuận lợi hay các yếu tốchính trịliên quan... Trong khi đó, Việc sửdụng các trang thiết bịphân tích hiện đại đã cho phép thu được khối lượng thông tin rất lớn, cho mỗi nghiên cứu riêng biệt. Kết quảlà trong hầu hết các trường hợp, bằng các phương tiện thông tin truyền thống (tạp chí, sách, hội nghị, hội thảo khoa học...) nhìn chung không đủdung lượng và môi trường đểtruyền tải hết ý tưởng và dữliệu kết quảnghiên cứu của các tác giả. Đây cũng là một nguyên nhân dẫn tới khảnăng thất thoát tài nguyên trực tiếp hay gián tiếp, do lạc hậu vềthông tin nên có thể ởnơi này vẫn đang tiêu tốn tiền bạc vào các mục tiêu nghiên cứu đã được giải quyết thành công ởnơi khác. Trong khi đòi hỏi thực tiễn đặt ra cho sựphát triển toàn diện và sâu rộng công nghệsinh học ngày càng trởnên cấp bách.

Nhưmột hệquảtất yếu đểgiải quyết các vấn đềtrên, các trung tâm dữ liệu công nghệsinh học đã ra đời và phát triển hết sức nhanh chóng, trên cảhai mặt quy mô và sốlượng các đơn vịthành viên.

NỘI DUNG:

Đại cương vềinternet

2.1. Khái niệm vềinternet và địa chỉtrên mạng 2.2. Thông tin trên internet

2.3. Một sốdịch vụtrên internet

2.4. Truy cập tìm kiếm dữliệu thông tin qua internet

3.Cơsởdữliệu công nghệsinh học

3.1. Đại cương

3.2. Đặc điểm của dữliệu công nghệsinh học

3.3. Một sốcơsởdữliệu sinh học lớn trên thếgiới

3.3.1. Cơsởdữliệu Trung tâm Thông

tin Quốc gia vềCông nghệSinh

học Mỹ

3.3.2. Cơsởdữliệu EMBL

3.3.3. Cơsởdữliệu CBI-DDBJ

4. Nghiên cứu cấu trúc chuỗi DNA và amino axit 4.1. Cơsởxây dựng chương trình xửlý dữliệu

4.2. Nghiên cứu so sánh cấu trúc chuỗi

5. Chương trình phân tích cấu trúc chuỗi CLUSTALW

5.1. Đại cương vềchương trình CLUSTAL

5.2. Sửdụng chương trình

6. Chương trình thiết kếvà lựa chọn đoạn mồi Primer3

6.1. Đại cương

6.2. Thao tác sửdụng chương trình

7. Chương trình phân tích cấu trúc tương đồng BLAST

7.1. Đại cương

7.2. Sửdụng chương trình BLAST

8. Chương trình hiển thịphân tích cấu trúc không gian Cn3D

8.1. Đại cương

8.2. Sửdụng chương trình

8.2.1. Sửdụng công cụtìm kiếm cấu trúc chuỗi qua Entrez

8.2.2. Từdịch vụentrez sequence neighbor

8.2.3. Từdịch vụphân tích cấu trúc chuỗi BLAST

8.2.4. Sửdụng mã hiệu chuỗi PDB Identifier

9. Tra cứu dữliệu qua Internet

9.1. Dịch vụPubMed

9.2. Dịch vụthưviện qua mạng ScienceDirect®

9.3. Dịch vụEntrez của NCBI và SRS của EBI

10. Khai thác thông tin cơsởdữliệu cấu trúc đểthiết kếgen

10.1. Cơsởdữliệu RFLP (Restriction Fragment Length

Polymorphism)và cơsởdữliệu ESTs (Expressed

Sequence Tags)

10.1.1. Cơsởdữliệu RFLP (Restriction

Fragment Length Polymorphism)

10.1.2. Cơsởdữliệu ESTs (Expresed

Sequence Tags)

10.2. Khai thác thông tin cơsởdữliệu chuỗi

trong thiết kếvà tách dòng gen

10.2.1. Tách dòng gen trên các loài đã biết cấu trúc di

truyền

10.2.2. Thiết kếtách dòng gen từchủng mang hoạt tính

gen

10.2.3. Thiết kếtách dòng gen từcác chủng mới

Tài liệu tham khảo

LINK DOWNLOAD

NỘI DUNG: